Anul competițional 2016-2017 va reuni la start, în divizia secundă, 26 de echipe. Cluburile înscrise au fost repartizate în două serii, una de 14 și alta de 12 formații.
Știința Bacău va face parte din Seria A (14 echipe), alături de Rapid București, ASC Șc. 181 București, CSU Neptun Constanța, ACS Spartac București, HM Buzău, Activ Plopeni, Dinamo București, HCF Piatra Neamț, CSM II București, CSU Știința București, CNOT Iași, SCM Pitești, CSU Târgoviște.
În Seria B vor evolua 12 echipe, astfel: CS Minaur Baia Mare, SC Mureșul Tg Mureș, CSM Slatina, CSȘ Caracal, ACS Avram Iancu Arad, ACS Crișul Chișineu-Criș, CSU Univ. de Vest Timișoara, ACS Sepsi Sf. Gheorghe, CSU Oradea, CSU Reșița, CNE Brașov, CS Extrem Baia Mare.
Tragerea la sorți pentru campionatul 2016-2017 va avea loc luni, 22 august, de la ora 11.00, la sediul Federației Române de Handbal.